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环肽药物作为医药领域的一颗冉冉升起的新星,其独特的结构和卓越的功能引起了全球科研人员的广泛关注。这些环状分子以其高稳定性和选择性,为治疗多种疾病提供了新的治疗策略。在环肽药物的研究中,基因编码展示技术和mRNA display技术发挥了重要作用。
mRNA display技术的应用范围广泛,不仅包括多肽和蛋白质适体的发现,还涵盖了蛋白质相互作用机制的深入阐明和分析,为环肽药物的研究提供了强有力的技术支持。
s36沙龙会云讲堂邀请生物部高级研究员/项目经理刘超博士为您解答环肽药物研发中常见的问题,一起看看吧!
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1 筛选获得的大环肽有重复的序列吗?
刘超博士:确实存在这样的情况。在我们的测序分析中,我们发现了一些重复的序列。有时,这些重复可能意味着某个序列被多次筛选出来,导致拷贝数增加。可能有三个或四个序列指向同一个大环肽。对于这些具有相同序列的情况,我们将在后续的SPR验证或合成过程中给予重点关注。
2 如果可以提供靶点蛋白,我必须携带列出来的GST或者Fc标签吗?是否能换成其他的纯化标签吗?
刘超博士:可以通过下图看到文库的基本信息,环肽本身带有His标签的,标签是为了辅助环肽的提纯过程,除了His标签之外,其他各种标签也可用于靶点蛋白的纯化。这些靶点蛋白上的标签的关键作用是固定靶点蛋白,确保其在实验过程中的稳定地固定在beads上。
3 想问一下mRNA的环肽展示技术可以和生物合成相结合?利用植物中的环化酶去环化?
刘超博士:可以的,环化酶是通过两个环肽,类似直播中提到的半胱氨酸成环的。在我们实验室,环化是通过化学方法进行的,确保了环肽的完整性和功能性。环化完成后,我们会进行纯化步骤,以确保获得的环肽是完整且可以顺利结合的。这一纯化过程对于保证环肽的质量和活性至关重要,确保了我们能够提供高质量的环肽产品。
4 你们如何进行QC检测的?
刘超博士:我们采用的是高通量测序技术,目前还在开发LC-MS的方法。在实验的早期阶段,我们通过银染技术进行定性分析,以确保翻译过程中多肽的生成和翻译的顺利进行。在mRNA/cDNA与大环肽共轭物阶段,我们利用二代高通量测序技术,这有助于在筛选前确保文库的质量,并提供更准确可靠的数据。
5 请问通常mRNA筛选一轮需要多久?
刘超博士:从DNA文库到完成筛选和测序的整个流程,我们预计需要大约5至6周的时间。这个时间框架主要是由于文库测序阶段相对较长,大约需要两周左右。实际上,如果只考虑操作过程,完整的操作可以在两周内完成。
如果您对于新药研发临床前研究过程中有一些困惑或者想要深入了解的专题内容,可以留下您的问题和建议,s36沙龙会希望和您一起,探索新药研发的奇妙世界。